ロケットカンパニーから「メダロット ガールズミッション カブトVer./クワガタVer.」
の発売が決定した。対応機種はニンテンドー3DS。発売日は2016年3月10日。
価格は5,800円（税抜）。
「メダロットガールズミッション」は新生メダロットとして始動する、
20人のかわいい女の子たちがいっぱい登場する爽快アクションゲーム。
「カブトVer.」は“女鷹農業高校”、「クワガタVer.」は“帝鳳高校”のキャラクターと
メダロットをメインに、“アルテミスカップ”の優勝を目指す少女たちの戦いのドラマを描く。
ロボトルはメダロット同士の2VS2のチーム戦で展開。XYBAの各種ボタンと機体が
連動し、簡単操作の戦闘が可能。相手の2機の頭部を破壊し、機能停止させたチームが
勝利となる。部位を破壊することでカットイン演出が挿入。バディの女の子と一緒に戦って
友好度が上がると、合わせてそのメダロットも徐々に強くなっていく。
また、各バージョンごとに限定女の子（主人公＆バディ）が登場。メダロットは100体以上
登場し、パーツを組み合わせて自分好みにカスタマイズ可能。対戦に勝利することで
貰えるポイントを使用して機体の能力を上げる要素もある。
「カブトVer.」では女鷹農業高校に通う一年生・豊穣みのりとその相棒、メタビーが
主役となって物語を牽引。「クワガタVer.」では政財界の子息が多い名門、帝鳳高校
一年生・海堂めぐみとロクショウ。会話パートとロボトル（バトル）パートを交互に繰り返す
ことで物語が進行。最初はバージョンごとの主人公しか選択できないが、シナリオを
クリアすることで徐々にほかの女の子たちや新モードが開放されていく。勝利した相手は
以後、共闘することが可能に。やりこみ要素のミッションも収録。
インターネットを利用したオンライン対戦やローカル対戦に対応。オンラインは
1対1のフレンド対戦とランダム対戦、ローカルは最大4人が入り乱れるチーム対戦と
ストーリーモード中に友人がバディになる協力ロボトルが楽しめる。パーツ配信も存在。
出演声優はカブトVer.の主人公・豊穣みのり役の木戸衣吹、クワガタVer.の
主人公・海堂めぐみ役の洲崎綾のほか、小笠原早紀、佐倉綾音、ブリドカットセーラ恵美、
藤井美波、浅川悠、青木志貴、白石真梨、中村繪里子、阿澄佳奈、北川里奈、
五十嵐裕美、東山奈央、五味紗也加、加隈亜衣、Lynn、藤村歩、小林ゆう、千葉泉
の計20名。
■キャラクター＆キャスト
●豊穣みのり：木戸衣吹（カブトVer.限定 主人公、相棒はメタビー）
女鷹農業高校、通称“メダノー”に通う1年生。明るく元気、心優しい性格で
周囲を引っ張っていく。所属：女鷹農業高校
●海堂めぐみ：洲崎綾（クワガタVer.限定 主人公、相棒はロクショウ）
政財界の子息が多い名門、帝鳳高校の1年生。おとなしい性格だが、
世間知らずで好奇心旺盛なお嬢様。所属：帝鳳高校
●谷川みずほ：小笠原早紀（カブトVer.限定、相棒はポンポンメイツ）
みのりのバディ。メダノー・ロボトル部の部長で、優しすぎる性格のオタク。
所属：女鷹農業高校
●七星つばさ：佐倉綾音（相棒はペッパーキャット）
夢は最強メダロットアイドルと芸能界。所属：県立アラカワ女子高校
●鶴来一子：ブリドカット・セーラ・恵美（相棒はブルースドッグ）
強面だけどやさしいしっかり者。所属：県立アラカワ女子高校
●坂田リコ：藤井美波（相棒はマッドジャグラー）
ロボトル勝負師の孫娘。所属：ナニワMR塾
●後藤さくら：青木志貴（相棒はカネハチまーく2）
心を閉ざした最強の塾生。所属：ナニワMR塾
●白鳥翔子：浅川悠（相棒はダイチャンコ）
元女子相撲の横綱。所属：撫子体育大付属高校
●錦乃こい：白石真梨（相棒はゴクード）
自由奔放すぎる特待生。所属：撫子体育大付属高校
●†漆黒の闇†：中村繪里子（相棒はミネルーヴァー）
中二病のスーパーハッカー。所属：フジヨシ情報処理高校
●鳴子あすみ：阿澄佳奈（相棒はニンニンジャ）
謎の忍者女子高生。所属：フジヨシ情報処理高校
●国城さゆり：北川里奈（相棒はシミタートゥース）
カリスマ的リーダー。所属：セレクト防衛大付属高校
●滋野清美：五十嵐裕美（相棒はトップガンナー）
少々テングな期待の新人。所属：セレクト防衛大付属高校
●六角ケイ：東山奈央（相棒はシュタインベルガ）
容姿端麗なJKメダロッター。所属：ツクバMR高専
●保良木ユリ：五味紗也加（相棒はブリュンヒルデ）
エンジニア兼医学博士。所属：ツクバMR高専
●土御門ありす：加隈亜衣（相棒はアラクノスパイダ）
国内最強の退魔師。所属：平安京女学院
●源静：Lynn（相棒はサムライ）
ありす護衛の魔眼保持者。所属：平安京女学院
●ラウラ・バートリ：藤村歩（相棒はウィップワールド）
高貴なる魅惑の女王。所属：聖アダムス女学園
●涼風蘭：小林ゆう（相棒はバルブブルー）
ラウラに仕える男装の麗人。所属：聖アダムス女学園
●麻生とき：千葉泉（クワガタVer.限定、相棒はロールビューティー）
めぐみの幼馴染。麻生財閥の令嬢。帝王学を学び、血統による言霊の力を持つ。
所属：帝鳳高校